O Colégio Bom Jesus é um edifício com rés-do-chão e primeiro andar, concebido para dar resposta a três valências: Creche, Jardim de Infância e Primeiro Ciclo
do Ensino Básico.

O espaço Creche funciona no primeiro andar e é composto por quatro salas de atividades, um dormitório, duas casas de banho devidamente equipadas, uma copa de leites e um terraço com equipamento de rua.

O Jardim-de-infância, situado no rés-do-chão, é composto por três salas de atividades e uma casa de banho.

O Primeiro Ciclo tem ao seu dispor, no primeiro andar, quatro salas de aula, duas casas de banho e uma ludoteca.

De apoio às três valências existe ainda: um espaço polivalente, com duas casas de banho; cozinha e refeitórios; secretaria; sala de professores/educadores; sala de pessoal; gabinete médico; casas de banho; vestiário; lavandaria e espaço exterior, onde se concentram o parque infantil, o campo de jogos, a horta pedagógica e a mata.

De referir também, a existência de um elevador facilitador do acesso ao primeiro andar e a existência de um sistema de segurança na porta principal, que impede o livre acesso de estranhos à instituição, bem como a eventual saída de crianças.